Με έκταση 15 τ. χλμ. αποτελεί το μεγαλύτερο νησί του συμπλέγματος των Κουφονησίων. Νησί ορεινό και χωρίς λιμάνι, αξιόλογο κέντρο του Κυκλαδικού Πολιτισμού, σήμερα είναι ακατοίκητο, με μοναδικό κάτοικο μέχρι πρόσφατα ένα βοσκό από την Αμοργό.
Η θέα της από το Πάνω Κουφονήσι είναι επιβλητική: η κορυφογραμμή της διαγράφει μια γυναικεία μορφή ξαπλωμένη.
Πλήθος θρύλων τη θεωρούν το «χαμένο ιερό νησί της αρχαιότητας».